本发明公开了一种新能源汽车锂电池管理系统,由智能充电单元、主机控制单元、从机控制单元、电池箱热处理单元和负载控制单元组成。智能充电单元与主机控制单元通过总线进行通信,从主机控制单元获得控制指令来调节充电状态;所述主机控制器单元用于完成系统的整体控制;从机控制单元用于完成电池组各个参数的采集以及电池的保护;电池箱热处理单元用于确保锂电池组的高效工作;负载控制单元用于完成负载功率需求变换以及短路保护。本发明充分利用FPAA技术可重构特性和在线可编程特点,合理的替代相应的电路使得系统设计的柔性提高功耗降低;通过